FASTQ保存测序读段
压缩后的FASTQ仍可能达到数十GB或更大。
传输前后比较大小和校验值,比只看下载进度可靠。
BAM包含比对结果
参考版本、比对程序和参数会决定BAM中的坐标与标记。
文件需要和索引、参考版本及运行日志一起交付。
BAM包进入云端后,传输速度只是数据传输工作的一项条件;就BAM包而言,BAM包对应的时间、处理、样本来源和批次是否完整,会直接影响任务能否复现,也决定团队是否可以安全地继续协作。
表达矩阵已经经过处理
计数、过滤和标准化会改变矩阵含义。
行列标识、单位与生成方法必须写清。
断点续传需要最终验证
中断后继续传输可以节省时间,却不能代替完成后的完整性检查。
校验失败时应重新确认源文件和分片状态。
跨区域路径会改变耗时
本地接入、对象存储、网络路径和目标地区共同影响传输。
单次速度不能代表所有文件或时间段。
敏感字段要与研究文件分开
样本身份和实验数据不应无条件放进同一共享目录。
脱敏、最小权限和访问日志需要在协作开始前确定。
敏感字段进入云端后,传输速度只是数据传输工作的一项条件;就敏感字段而言,敏感字段对应的软件、参数、依赖和资源是否完整,会直接影响任务能否复现,也决定团队是否可以安全地继续协作。