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计算资源要和工作负载一起看

CPU、GPU、高内存、任务队列与科研计算环境说明。

同一份数据在不同算法和参数下,会产生完全不同的资源需求。申请资源前先理解任务的输入、并行方式和中间对象。

CPU与批处理

格式转换、质控、比对和统计任务常可分批运行。核心数量是否有效取决于软件能否并行。

GPU与显存

模型训练、图像计算和部分科学软件可以利用GPU。驱动、框架、显存和数据加载速度都会影响效果。

高内存任务

单细胞对象、大型图结构和跨样本整合可能需要较高内存。内存不足通常会直接终止任务,而不是只让它变慢。

任务队列

排队、运行、完成、失败和取消是不同状态。日志、退出代码和资源用量可以帮助判断是否需要重试。